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KRGDB 유전체 데이터베이스 구축

한국인 1,722명의 유전체 데이터 전처리·변이 분석·어노테이션에 참여했습니다.

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공공 보건 연구기관에서 2014년 1월부터 2017년 3월까지 한국인 유전체 데이터 분석에 참여했습니다. 연구 데이터가 분석과 조회에 쓰일 수 있도록 전처리하고, 변이 빈도와 공개 데이터베이스의 정보를 연결하는 업무를 맡았습니다.

담당한 분석

Linux·Python·Samtools를 사용해 염기서열 데이터를 전처리하고 분석했습니다. 집단 내 변이 빈도와 인구집단 간 차이를 확인하고, 공개 데이터베이스를 활용해 유전변이를 어노테이션했습니다.

연구 결과

KRGDB는 한국인 1,722명의 전장 유전체 시퀀싱에 기반한 변이 데이터베이스입니다. 관련 논문은 2020년 발표되었으며, 제가 참여한 분석 기간은 2014~2017년입니다.

KRGDB 논문(2020)

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